|
|
Mapping of regulatory elements within 5' region of the Disp3 locus
Oltová, Jana ; Bartůněk, Petr (vedoucí práce) ; Krásný, Libor (oponent)
Dispatched 3 (Disp3), gen regulovaný thyroidálním hormonem, je v naší laboratoři intenzivně studován. Podle fenotypu buněk s nadexprimovaným Disp3 a expresního profilu tohoto genu by Disp3 mohl být propojujícím článkem mezi thyroidálním hormonem a homeostázou cholesterolu v mozku. Domníváme se, že by také mohl hrát roli v patogenezi některých neurodegenerativních onemocnění a mozkových nádorů. Tato práce je zaměřena na proces regulace tohoto genu prostřednictvím receptoru pro thyroidální hormon (TR). Konkrétně si dává za cíl identifikovat responsivní elementy, které jsou důležité pro tuto regulaci. Navíc byly hledány také elementy rozpoznávané jaterním receptorem X (LXR), který nasedá na stejně uspořádané repetice jako TR a existuje mnoho genů, které jsou regulovány oběma těmito receptory. Zkombinovali jsme in silico analýzu Disp3 lokusu s luciferázovými reporterovými esejemi. Zaujal nás cluster šesti responsivních elementů predikovaných v blízkosti prvního exonu, z nichž dva se ukázaly být konzervované mezi myší a člověkem. Na základě toho byly připraveny reportéry různě zkrácených variant této 3 kb dlouhé oblasti, které umožnily tuto sekvenci analyzovat detailně. Reportérové eseje nepotvrdily přítomnost žádného klíčového responsivního elementu aktivovaného TR nebo LXR, ale na 3' konci byla objevena oblast...
|
|
|
Mapping of regulatory elements within 5' region of the Disp3 locus
Oltová, Jana ; Bartůněk, Petr (vedoucí práce) ; Krásný, Libor (oponent)
Dispatched 3 (Disp3), gen regulovaný thyroidálním hormonem, je v naší laboratoři intenzivně studován. Podle fenotypu buněk s nadexprimovaným Disp3 a expresního profilu tohoto genu by Disp3 mohl být propojujícím článkem mezi thyroidálním hormonem a homeostázou cholesterolu v mozku. Domníváme se, že by také mohl hrát roli v patogenezi některých neurodegenerativních onemocnění a mozkových nádorů. Tato práce je zaměřena na proces regulace tohoto genu prostřednictvím receptoru pro thyroidální hormon (TR). Konkrétně si dává za cíl identifikovat responsivní elementy, které jsou důležité pro tuto regulaci. Navíc byly hledány také elementy rozpoznávané jaterním receptorem X (LXR), který nasedá na stejně uspořádané repetice jako TR a existuje mnoho genů, které jsou regulovány oběma těmito receptory. Zkombinovali jsme in silico analýzu Disp3 lokusu s luciferázovými reporterovými esejemi. Zaujal nás cluster šesti responsivních elementů predikovaných v blízkosti prvního exonu, z nichž dva se ukázaly být konzervované mezi myší a člověkem. Na základě toho byly připraveny reportéry různě zkrácených variant této 3 kb dlouhé oblasti, které umožnily tuto sekvenci analyzovat detailně. Reportérové eseje nepotvrdily přítomnost žádného klíčového responsivního elementu aktivovaného TR nebo LXR, ale na 3' konci byla objevena oblast...
|
host ::
RSS.